J Integr Plant Biol. ›› 2003, Vol. 45 ›› Issue (2): 223-228.

• Research Articles • Previous Articles     Next Articles

Development of RAPD Markers and SCAR Markers Linked to Bentazon Susceptible Lethality Gene in Rice

XIANG Tai_He, YANG Jian_Bo, LI Li, NI Da_Hu, YANG Qian_Jin, ZHU Qi_Sheng, WANG Xiu_ Feng, ZHANG Yi and HUANG Da_Nian   

  • Published:2003-02-02

Abstract:

 

水稻苯达松敏感致死基因的RAPD标记和SCAR标记
向太和  杨剑波  李莉   倪大虎   杨前进  朱启升   汪秀峰  张毅 黄大年
(1. 浙江大学生命科学学院,杭州310012; 2.安徽省农业科学院水稻研究所,农业部水稻遗传育种重点开放实验室,合肥230031; 3.安徽省农业科学院绿色食品工程研究所,合肥230031; 4.中国水稻研究所,杭州310006)
摘要:利用RAPD技术对水稻品种农林8号(含苯达松抗性基因Ben)和其突变体农林8号m(含苯达松敏感致死基因ben)进行标记。从360个10bp寡核苷酸随机引物中筛选出5个引物产生的7个RAPD标记,经对多态性标记的克隆和序列分析。再设计PCR引物,将其中4个RAPD标记OPG18/943,OPG18/972,OPD10/1248和OPF03/1198转化成SCAR标记SACAR/G18/883,SCAR/G18/890,SCAR/G18/919/948、SCAR/D10/1237,SCAR/F03/1186。通过对农林8号×农林8号mF2分离群体320个单株的连锁分析及在1对含ben基因的近等基因系H121和Hben121中验证,标记SCAR/G18/883,SCAR/G18/890,SCAR/G18/919/948与Ben或ben基因共分离,SCAR/D10/1237与Ben基因的遗传距离为(14.8±2.1)cM。经Southern blotting分析并结合F2代分离比例表明,标记OPG18/943,OPG18/972及其转化的SCAR标记在基因组中为单拷贝序列。且OPG18/943和OPG18/972为一对等位STS位点,这是首次报道与ben或Ben基因相连锁的分子标记。本研究为利用分子标记辅助ben基因的转育及利用图位克隆技术分离ben基因提供了有用的分子标记。
关键词:水稻,苯达松敏感致死基因,RAPD标记,SCAR标记
通讯作者。Tel: 0551-2160449; Fax:0551-2160449; E-mail:bioinfo @ mail.hf.ah.cn 。

 

Editorial Office, Journal of Integrative Plant Biology, Institute of Botany, CAS
No. 20 Nanxincun, Xiangshan, Beijing 100093, China
Tel: +86 10 6283 6133 Fax: +86 10 8259 2636 E-mail: jipb@ibcas.ac.cn
Copyright © 2022 by the Institute of Botany, the Chinese Academy of Sciences
Online ISSN: 1744-7909 Print ISSN: 1672-9072 CN: 11-5067/Q
备案号:京ICP备16067583号-22